扁平疣与毛囊炎的区别在于外观形状不同。
扁平疣是由于病毒感染的皮肤病，发病初期在皮肤上只会隆起黄豆大小扁平的硬块，按着比较硬，不会有疼痛的感觉，时间长了以后颜色会逐渐加深，最后成为褐色，需要通过手术治疗。而毛囊炎是由于细菌感染的炎症，起病都比较急，发炎的毛囊会出现红肿，发热，疼痛等，只需要进行消炎抗菌治疗，一般在5天左右就能恢复。
建议：不管是扁平疣还是毛囊炎，都属于皮肤病变，可以先到皮肤科检查，期间注意皮肤的清洁卫生。