动脉导管未闭常见的并发症有发育迟缓、先天性的心脏病，与动脉导管的粗细有关。
如果是1-3毫米的动脉导管，一般不会存在潜在并发症。如果是中等大小的动脉导管未闭，如4-5毫米或者6-7毫米，孩子会表现出轻微的症状，这种情况下生长发育会受到一定的影响，孩子的活动量也会明显降低，会容易感到疲惫，而且患病的孩子比正常的孩子心跳会更快。如果是10毫米以上的动脉导管，可能会导致重度的肺动脉高压，而且是不可逆转的，严重的可能会造成不可治的先天性心脏病。
为了预防并发症，在检查出了动脉导管未闭时，就要及时治疗，一般可以采用封堵法和手术法。