阴茎短小是根据短小的原因来进行治疗的。如果是因为隐匿性阴茎等原因所导致的，那么建议可以到医院选择手术来进行治疗，可以将阴茎根部的脂肪垫去除，这样就可以使阴茎显得比较大一些。另外如果真的是因为染色体异常或者是体内激素水平紊乱导致的阴茎短小，那么就没有比较好的治疗方法，可以选择做阴茎延长增粗手术来治疗。