对于乙肝小三阳患者且肝功能不正常的情况，怀孕期间的用药需要特别谨慎。一般来说，如果肝功能损伤超过正常值的80%，且病毒载量（DNA）超过10^4拷贝/mL，可以考虑使用抗病毒药物进行治疗。
建议选择拉米夫定等药物进行治疗，这类药物在怀孕期间使用相对安全，对胎儿的影响较小。
需要注意的是，用药期间要定期监测肝功能和病毒载量，确保病情得到有效控制。
此外，新生儿出生后应立即进行乙肝免疫球蛋白注射和乙肝疫苗接种，以有效阻断母婴传播。
总之，乙肝小三阳患者在怀孕期间可以通过合理用药控制病情，同时保障胎儿的健康。