病情分析：您好！很高兴为你解答，根据你目前的描述看巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种，不知道检查囊肿有多大。一般巧克力囊肿超过三公分的话，是需要手术的，手术后生育环节都是正常的，是可以怀孕的。
意见建议：卵巢囊肿有生理性囊肿也有病理性的囊肿，如果您的囊肿有5cm大的话，多考虑病理性囊肿，病理性囊肿建议采取手术治疗，可以做腹腔镜手术，另外要根据内透声和血运情况判断囊肿的性质。建议去医院就诊。