治疗慢性结膜炎，必须先找出原因。若是环境刺激原引起的，则尽量减少接触刺激源，如减少到公共场所(尤其是密闭室内)、减少接触吸烟及燃烧废弃物之烟灰。若是过敏原引起的，则避免接触花粉、油漆、灰尘。若长期使用眼药水或眼药膏所引起的，可先停用眼药一段时间，点用不含药物及防腐剂之眼药水(如生理食盐水或人工泪液)；而以毛巾热敷眼部(闭眼睛)一天三至四次，每次五至十分钟，也是简单易行而有效之方法。