心肌炎患者的预后取决于其所患心肌炎的类型和心肌损害的部位、范围、程度，以及原来的心脏机能状态、有无并发症、治疗是否及时等多种因素。一般而言，绝大多数病毒性心肌炎患者预后良好，多在数周至数月内完全恢复，可治愈，仅有极少数患者遗留所谓的“后遗症”，表现为心电图异常，其中大部分为早搏，个别患者可发展为扩张型心肌病，甚至导致猝死。风湿性心肌炎患者较病毒性心肌炎患者容易发生心力衰竭，甚至急性肺水肿。特发性心肌炎患者预后较差，可于数周内死于进行性心力衰竭。心肌受损部位局限；范围小、程度轻的患者预后好，反之则差。另外，是否及时休息治疗对于心肌炎患者的预后也 有较大影响，若患者未得到及早的休息及治疗，一方面可使心肌炎病情进一步恶化，另一方面也导致各种并发症的出现，使得以后的治疗产生困难，不利于疾病的恢复。