巧克力囊肿（巧囊）是子宫内膜异位症的一种。目前治疗内膜异位症的药物，在服药期间患者一般月经停止来潮，痛经的症状可以得到缓解。药物也可以抑制异位子宫内膜的生长。但巧囊，顾名思义其囊内液是一种类似巧克力的、十分稠厚的液体，其吸收过程是极其缓慢的，临床上常见绝经多年的患者巧囊仍持续存在。因此，药物治疗可能会使巧囊的体积有所缩小，
但消除巧囊的比较困难。如果药物治疗后症状不缓解、局部病变加剧或生育功能仍未恢复者或巧囊直径大于5--6cm，特别是迫切希望生育者，可以考虑经过腹腔镜手术剔除