结膜炎的治疗，若是急性病毒性结膜炎，可点用类固醇（可地松）眼药水，以减轻病。细菌性结膜炎，则须投与抗生素药水、药膏，甚至口服或注射抗生素。
治疗慢性结膜炎，必须先找出原因。若是环境刺激原引起的，则尽量减少接触刺激源，如减少到公共场所（尤其是密闭室内）、减少接触吸烟及燃烧废弃物之烟灰。若是过敏原引起的，则避免接触花粉、油漆、灰尘