您好，根据您的情况，自然流产不全14天后发现右侧附件区有3.7*2.5cm囊肿，宫颈Ⅱ°糜烂以及慢性盆腔炎。这种情况需要综合治疗，以下是我的建议：
首先，您需要明确诊断。自然流产不全可能引起感染或子宫内膜炎，导致右侧附件区的囊肿可能是由于感染、血块积聚或其他原因引起的。建议进一步检查血液常规和C反应蛋白（CRP）以评估感染情况。
治疗方面：
抗生素治疗：根据细菌培养结果选择敏感抗生素控制感染。
清宫术：如果存在子宫内残留物，需及时清除以防感染加重。
囊肿处理：若囊肿为脓肿，可能需要穿刺引流或手术切除；若是功能性囊肿，则需观察。
宫颈糜烂和慢性盆腔炎治疗：可采用物理疗法（如LEEP刀）结合药物治疗，并注意个人卫生。
建议：
避免性生活及盆浴，以防感染加重。
按时复查B超，监测囊肿变化及炎症情况。
保持良好的生活习惯，增强免疫力。
请您及时就医，遵医嘱治疗。祝您早日康复！