导致月经周期紊乱的原因可以分为两大类：
第一类是神经内分泌功能失调，主要涉及下丘脑、垂体和卵巢轴的功能异常，这种情况可能导致所谓的“月经病”。
第二类则是由器质性病变或外部因素引起的，包括生殖器官的炎症、肿瘤或发育问题，以及营养不良等。
此外，内分泌系统其他部分的问题，如甲状腺功能异常或糖尿病，也可能导致月经不调。
某些药物，尤其是用于治疗精神疾病的药物，或者使用宫内节育器避孕的情况，都可能引发月经周期的变化。特定职业，比如长期进行剧烈运动的女性，也可能会出现闭经现象。
还有一种情况是妊娠期的异常出血，常被误认为是月经不调。因此，在诊断时必须先排除这些器质性原因，以确定具体的问题所在。