您好！根据您描述的情况，您的宝宝从出生后就出现了新生儿肺炎，并且已经住院治疗了12天。首先，我想了解一下宝宝的具体情况：是否有早产？孕期中是否出现过感染或其他并发症？这些信息对于判断病因非常重要。

新生儿肺炎的病因可能有多种，包括感染（如细菌或病毒引起的）、吸入性肺炎（比如羊水吸入）或者某些先天性疾病（如气道畸形）。建议您尽快带宝宝到儿科专科医院就诊，进行详细的检查，包括但不限于血常规、胸片、血液培养以及可能的心脏和肺部超声检查。

此外，我建议您与主治医生详细沟通治疗方案。如果怀疑是微量元素缺乏引起的，可以通过检测血清中的锌、铁、钙等元素水平来确认。同时，也要注意宝宝的营养支持和免疫功能调理。

最后，请保持良好的心态，积极配合医护人员的工作，给宝宝更多的关心和爱护。如果有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时联系专业的儿科医生。