肾结石的治疗目标是解除症状、保护肾脏功能，并尽可能找到病因以防止复发。治疗方法包括一般治疗、药物治疗、体外冲击波碎石（ESWL）、腔内泌尿外科手术以及中西医结合治疗。
对于较小的结石，可以采用大量饮水配合利尿解痉药物促进结石排出。建议每日摄入2000-3000毫升液体，并在夜间起床排尿后再次饮水以稀释尿液，减缓结石增长速度。
在肾绞痛发作时，多喝水可能会加重疼痛，但若配合针灸和解痉药物，则有助于缓解症状。对于较大的结石或位置复杂的结石，可能需要采用体外冲击波碎石或腔内手术治疗。
中西医结合治疗方面，中药可以帮助促进结石排出，同时建议适当运动以辅助治疗。总体而言，现代治疗方法如ESWL及腔内泌尿外科技术已显著提高了治疗效果，仅在少数情况下需要手术处理。