多囊卵巢一旦确诊，最好是及早手术治疗，腹腔镜下卵巢打孔术或部分切除是PCOS最有效的治疗手段，术后6个月妊娠率达90%以上,但PCOS多伴有子宫纵隔或子宫内膜息肉，确诊需做数字化动态子宫输卵管碘油造影或宫腔镜检查，如有应行宫腔镜下纵隔、息肉切除术，否则易导致习惯性流产。 药物治疗是手术后的辅助手段，单纯应用无效，用药后即使月经能够规律来潮，也不会怀孕，原因是这些药物多是避孕药（如达因35等）。最不可取的是停药立刻复发，等于白治。术后选择适当辅助药物会使激素和代谢很快恢复到正常水平，有时会起到立竿见影效果。 药物选择是根据不同类型来选择药物，如高雄血症和痤疮型，可以用达因35；高脱氢表雄酮可以用强地松高泌乳素血症型，可以选用嗅隐停；高胰岛素型，选用二甲双呱；肥胖型，选用降血脂和减肥药物；高17羟孕酮型，选用罗内酯（安体舒通）；高雌血症型，可以选用三苯氧氨等等。 具体用药方案和时间还是个体化原则，必须尊医嘱执行。早期治疗可预防体型肥胖改变，预防雌激素对子宫内膜的长期持续刺激、绝经后延易导致子宫内膜癌。