你好！
两者是不同生长在卵巢上的囊肿！

巧克力囊肿这个是子宫内膜异位到卵巢导致的，经常会出现不正常的痛经。痛经这个是子宫内膜异位最明显的症状。
同房患侧疼痛，可能还伴有点状出血。 没有避孕也不会怀孕。在不孕的女性中，子宫内膜异位造成的不孕是占有很高的比例。

而黄体囊肿则是病例情况下黄体直径超过2.5cm则称黄体囊肿。常使月经周期延迟。若囊肿破裂可出现腹痛及阴道流血。

两者病因是不一样的！