生殖器疱疹是一种由单纯疱疹病毒侵犯生殖器皮肤、黏膜引起的红斑、水疱、糜烂、溃疡性损害的性传播性疾病。虽然目前治疗生殖器疱疹的药物较多，但此病复发率较高，尚无有效根治办法。治疗可分系统治疗和局部治疗，以系统治疗为主，可同时辅以心理疗法。
系统治疗是采用系统用药方式并对疗程进行跟踪观察，这方面药物较多。如阿昔洛韦、伐昔洛韦、泛昔洛韦、西多福韦、磷甲酸钠、干扰素、消炎痛、左旋咪唑以及中药等。由于阿昔洛韦、伐昔洛韦、泛昔洛韦是最常用而有效的药物，它们对原发和复发性疱疹都有较好疗效，现简要介绍于下（本文内用药剂量仅供参考，用药时请按医嘱执行）：
⑴阿昔洛韦：临床应用已达20余年，其疗效及安全性已被肯定，可缩短病程，减少病毒排放，促进皮损愈合。原发性生殖器疱疹：每次服200mg，每日5次，连服7～10天。复发性生殖器疱疹：最好在前驱症状或损害出现24小时内口服200mg，每天5次，连服5天；或者复发前驱症状出现时立即口服800mg，每天1次，连服7天。如疱疹频繁发作（1年复发6次以上），可口服400mg，每日2次；或口服200mg，每日3次，连服4～12个月，据报道，可使80%～90%病人复发次数降低，连服3年可消除感染。
⑵伐昔洛韦（商品名为明竹欣及丽珠威）：为阿昔洛韦的前体左旋缬氨酸酯，亦是核苷类药物。口服后迅速吸收，且几乎完全水解转化为阿昔洛韦。原发性生殖器疱疹：口服300mg，每日3次，连服7～10天。复发性生殖器疱疹：最好于前驱症状或损害出现24小时内治疗，口服300mg，每日2次，连服5天。如发作频繁，为减少复发次数，可口服300mg，每日1次，连服4～12个月。
⑶泛昔洛韦：一种新的开链鸟苷衍生物，口服吸收后在体内迅速水解出母体喷昔洛韦及三磷酸阿昔洛韦，具有抗疱疹病毒作用