您好：
巧克力囊肿是子宫内膜组织在卵巢异常生长形成的，常与激素水平变化有关。
您目前存在输卵管积脓情况，这可能是由于感染导致的炎症反应，需要及时处理以避免进一步并发症。
腹腔镜手术是一种有效的治疗方法，可以明确诊断并进行必要的治疗操作。
至于您的月经周期不规律问题，可能与多种因素有关，如激素水平波动、卵巢功能变化等，这些可能与当前发现的妇科问题无直接关联。
建议您遵循医生的专业指导，完成进一步检查和治疗。