根据你的描述，淋病咽炎的治疗已经完成，但咽喉部仍有不适症状，这可能与多种因素有关。
首先，需要明确是否存在其他呼吸道感染，如普通感冒或支气管炎。建议进行胸部X光检查以排除肺部感染的可能性。
其次，治疗后的咽喉不适可能与抗生素使用有关，部分患者在使用某些抗生素后可能会出现胃肠道不适或其他副作用，但这通常不会直接导致喉咙痰感。
此外，淋病治疗后的随访也很重要，确保彻底治愈。建议你继续观察症状变化，并保持良好的休息和饮食习惯。
如果症状持续或加重，请及时就医进一步检查和治疗。