根据您描述的情况，患者目前有两处小结石，分别位于右肾和左输尿管。对于这种较小的结石（直径约4毫米），通常建议采取非手术治疗方案。
首先，可以考虑使用药物排石的方法。中药可以帮助缓解症状，并促进结石自然排出。同时，α受体激动剂类药物可以通过放松输尿管平滑肌，帮助结石顺利通过。
其次，增加每日饮水量是非常重要的。多喝水不仅能稀释尿液，还能减少结晶形成，有助于小结石的排出。
如果药物治疗效果不佳，或者患者出现明显腰痛、血尿等症状时，可以考虑微创手术治疗，如体外冲击波碎石术（ESWL）或输尿管镜取石术。
建议在专业医生指导下制定具体治疗方案，并定期复查B超或X光片，观察结石变化情况。