如果是肝脏的囊肿比较小，不需要特别的治疗，可以定时进行检查。但若囊肿大且有挤压感，应立即进行囊肿开窗手术。如有炎症、囊液中有胆汁，应在开窗手术后进行导管引流。若有多囊肝脏的征象，应尽早进行肝脏移植。在日常生活中要注意保持情绪的放松，不要过于紧张和焦躁。另外还要注意多做一些运动，比如慢跑、游泳等，有助于改善症状。

肌腱囊肿可保守治疗，也可以手术进行治疗。
肌腱囊肿又称为腱鞘囊肿，指肌腱腱鞘或关节处的韧带发生劳损性炎症，引起局部组织膜下积液，积液量渐多，可形成囊肿。腱鞘炎主要是因为长期的紧张劳累以及不良生活方式等因素造成。腱鞘囊肿可局部压揉，有时可将积液捏碎吸收囊壁粘连即可。如囊肿较大，不只影响美观，也会带来痛苦，就必须考虑手术切除。

一般情况下，卵巢囊肿患者可以通过医学检查、手术治疗等方式进行治疗。具体情况分析如下：
如果是直径在5cm以下的卵巢囊肿，同时检查CA125、CA19-9、CEA、AFP等指标是否在正常范围内，可以在月经结束后进行妇科彩超检查。如果是一个直径超过5cm的卵巢囊肿，同时还要做妇科彩超检查。卵巢囊肿外科治疗通常是对有需要或尚未绝经的妇女，应行腹腔镜下摘除或剖腹切除。如果是绝经期后的妇女，或者是因为有恶性肿瘤的原因，需要进行手术治疗。

腮腺囊肿不会自己恢复，腮腺一般不会引起囊肿，腮腺里的囊肿往往是鳃裂囊肿，它是一种先天发育的囊肿。不管是腮腺本身的囊肿，还是鳃裂囊肿，治疗原则都是手术治疗。如果是鳃裂囊肿，手术的时候就切开腮腺，沿着囊肿的包膜进行剥离，将囊肿完整摘除就可以了。如果是腮腺囊肿，需要摘除一定的腮腺组织，手术当中要注意保护腮腺里的面神经，防止出现临时性面瘫或者永久性面瘫。

腮腺囊肿分为潴留性和先天性。潴留性囊肿，是由于腮腺的导管弯曲或者受到了阻塞，分泌的唾液在局部潴留就会使得导管囊性扩张，而且会不断增大，形成潴留性腮腺囊肿，其中的成分主要是唾液。

牙床囊肿应该及时的到牙科医院进行就诊，必要的时候可以服用消炎抗病毒的药物来进行治疗，而且在治疗期间要避免吃上火的食物，饮食方面要注意清淡化。要做到每天的早晚刷牙，定期的去复查。

腱鞘囊肿可伴有长期劳损、感染等，伤害和其他原因之间存在某种联系。患者一般会出现一侧或者双侧疼痛的症状，也有一部分是单侧疼痛。以病部圆形肿块为主，有些酸疼。随着人们生活水平不断提高，越来越多的人患有不同程度的腱鞘炎症状。对腱鞘囊肿有非手术治疗与手术治疗两种。非手术治疗就是用药物或者是针灸来进行治疗。保守治疗是用挤压的方法将腱鞘囊肿击碎，接着，泡液就渐渐地自己吸收了，但也存在一定复发机会。手术疗法是对已经发生了病变的患者进行彻底的破坏。操作方法是可摘除腱鞘囊肿，手术后注意防护，避免反复发作。

胆囊肿有囊肿穿刺引流、无水酒精注射、传统的开刀和腔镜囊肿开窗引流术以及囊肿部分肝脏切除术，现在多选择腔镜下肝囊肿开窗引流术，无水酒精注射或穿刺引流基本淘汰，位于肝脏边缘的囊肿可以采取包括肝脏部分切除的手术。

肝囊肿，肾囊肿的治疗需要根据囊肿的大小以及部位，以及临床表现。如果囊肿较小并且没有明显的临床表现可以随访观察，如果囊肿较大有引起压迫症状，需要择期手术治疗，肾囊肿去检查囊肿的大小，对于比较大的囊肿可以进行手术切除，如果是比较小的囊肿或者是对周围组织影响不大的囊肿不需要治疗，但是需要定期去复查。建议要多吃高纤维的食物，不要吃辛辣刺激的食物。在日常生活中要注意休息，避免劳累。

宫颈囊肿附件囊肿可以采纳激光治疗，或做囊肿切除术。减少刺激性食物，忌油腻，忌饮酒，忌海鲜，忌腥荤及发物，多食水果蔬菜。平时应注意个人卫生，注意锻炼身体，适当注意营养卫生，保障身心健康，保持外阴清洁，防止病原体侵入引起发病。