3个月宝宝腹泻可遵医嘱口服肠道益生菌、蒙脱石散治疗。
3个月宝宝腹泻与肠道菌群失衡有关，调节肠道菌群失常，家长可以在医生指导下给宝宝口服肠道益生菌。口服益生菌能够提高肠道抵抗力，增加肠道中有益菌的存在，促进肠道功能恢复，缓解腹泻，提高宝宝的免疫力。
腹泻比较严重的患者适当服用蒙脱石散，可以吸附肠道中的病毒和细菌，改善肠道细胞的吸收和分泌功能。

腹泻有细菌性的；病毒性的；和生理性的；细菌性和病毒性都是感染性的疾病需要药物治疗，生理性是小孩消化系统不完善，又接受不了食物在肠道的消化和吸收所致的，可去医院做个大便常规，鉴别后在给予合理的治疗方案。

一般情况下，两个月婴儿腹泻，可以通过生活管理、药物治疗等方式进行治疗。
1.生活管理：两个月婴儿腹泻可能是受凉导致的，建议家长做好生活管理，可以给其腹部进行顺时针按摩，注意给其多喝水，避免出现脱水的现象，也要勤洗屁股，勤换尿布。
2.药物治疗：两个月婴儿腹泻可能是饮食不洁导致的，如果病情比较严重，建议遵医嘱使用蒙脱石散、小儿胃宝片、乳酸菌素片等药物进行治疗，能够起到止泻的作用。

新生婴儿腹泻可通过以下4种方法来恢复：
1、夏季要给婴儿多喝水，多喝水可以保护婴儿的肠道功能，避免婴儿肠胃不舒服导致腹泻。
2、婴儿腹泻首先要找出腹泻的原因，如果是体质差的婴儿，可以通过服用止泻的药物来调节婴儿的体质，如果婴儿胃肠比较弱，腹泻的婴儿可以只吃奶，不吃辅食，等身体好了再吃。
3、婴儿腹泻是由细菌感染引起的，病原体会随着食物和水进入婴儿的消化道，所以给婴儿喂食时一定要注意卫生，餐具要消毒，避免感染。
4、婴儿腹泻可以通过饮食治疗，通过合理的饮食来治疗，主食以流质食物为主，同时还要多吃蔬菜水果。

检查化验大便是因为消化不良还是因为肠炎，同时在此期间要多喝温水，不吃凉的不易消化的东西，顺时针给按摩肚子，促进肠胃蠕动，可以很好的缓解腹胀的现象。同时母乳喂养的宝宝也要注意妈妈的饮食。

如果要是严重，还是要去医院然后进行治疗。当然可以服用一些药物。它主要是针对小孩儿脾气虚弱。上吐下泻。多补充有营养的物质。睡眠也要保持充足，这些可能会增强宝宝的免疫力。

宝宝腹泻考虑是因为消化不良或是由于肠胃功能紊乱所导致的情况，考虑还是和妈妈的饮食有关系，妈妈要注意避免辛辣刺激油腻生冷的食物以及不易消化的食物，妈妈应少吃一些脂肪类食物，以避免乳汁中脂肪量增加，给宝宝服用一些肠道益生菌，同时每次喂奶前，母亲饮一大碗开水，稀释母乳，有利于减轻宝宝腹泻症状。

引起宝宝拉肚子的原因，最常见的是着凉消化不好，如果经过益生菌调理的话不能好转，还不能排除肠炎的可能。建议给宝宝服用相关药物同时，可以考虑给宝宝再补充，如果不能好转的话，应该给宝宝化验一下大便常规。

婴儿出现腹泻，要确定是生理性腹泻还是病理性腹泻，可以先做一个大便常规检查，确定一下大便中有没有白细胞的情况，如果有白细胞的话，还是考虑细菌感染引起来的病，理性腹泻，必须要口服止泻的药物对症治疗，如果是由于宝宝的胃肠功能还没有发育完全导致的，必须要口服双歧杆菌。

婴儿腹泻注意不可以禁食，不管何种病因的腹泻，婴儿的消化道功能虽然降低了，但仍可以消化吸收部分营养素，如果婴儿腹泻严重，伴有呕吐、发烧、口渴、口唇发干，这是已经引起脱水了，要保证喂水。另外不要滥用抗生素。家长应仔细观察大便的性质、颜色、次数和大便量的多少，将大便异常部分留做标本以备化验来查找腹泻的原因。