嘴巴里面长水泡可能是单纯疱疹、口腔溃疡、黏液腺囊肿、过敏反应、烫伤或机械损伤等所致，建议及时就医，根据病因采取日常护理、药物治疗、手术治疗。
1.单纯疱疹：由单纯疱疹病毒感染引起。可在口唇等部位出现成簇小水泡，伴有疼痛。应注意休息，提高免疫力。可外用阿昔洛韦乳膏、喷昔洛韦乳膏、重组人干扰素α2b乳膏等。若症状严重可口服阿昔洛韦片、伐昔洛韦片等抗病毒药物。
2.口腔溃疡：表现为口腔黏膜的溃疡或水泡，可能与免疫、遗传、精神因素等有关。注意口腔卫生，避免辛辣刺激食物。可使用口腔溃疡散、西瓜霜喷剂、康复新液等促进愈合。
3.黏液腺囊肿：因黏液腺导管堵塞，黏液潴留形成囊肿，可表现为水泡样，一般需要手术切除。
4.过敏反应：食用某些食物或接触过敏原后，口腔内可出现水泡。应避免接触过敏原，可口服抗组胺药，如氯雷他定片、盐酸西替利嗪片、依巴斯汀片等。若水泡较大影响呼吸等，应及时就医处理。
5.烫伤或机械损伤：过热食物烫伤或牙齿咬伤等可导致口腔内出现水泡。避免刺激水泡，若水泡较小可自行吸收。若较大可由医生在无菌条件下刺破，使用复方氯己定含漱液等预防感染。
如果嘴巴里面长水泡情况严重或持续不缓解，应及时就医，明确病因后在医生的指导下进行治疗，用药谨遵医嘱。同时要注意口腔卫生，避免刺激患处。