金黄葡萄球菌肺炎的治疗费用会因治疗方法、医院科室、地区等不同因素而有所不同。一般来说，需要住院治疗的话，费用会比较高。据资料显示，普通医保患者在三甲医院治疗金黄葡萄球菌肺炎的平均费用为2万-3万左右，不同地区和医院的费用也会有所差异。建议就诊时提前了解医院的收费标准和诊疗方案，以便做出正确的决策。