肛瘘的最佳治疗时间没有明确的准确答案，因为治疗时机取决于多种因素，例如疾病的严重程度、患者的整体健康状况以及治疗的可行性等。
一般情况下，肛瘘治疗的时机应尽早确定，以避免疾病的进一步恶化。如果肛瘘引起疼痛、排便困难、渗液等明显症状，或者出现化脓、感染等并发症，就应及早寻求医疗治疗。
具体的治疗时机应由医生根据患者情况综合考虑来决定。一般情况下，肛瘘的治疗目标是清除感染、修复肛管的解剖结构，以及促进伤口愈合。根据不同的肛瘘类型和临床特点，可能需要采用不同的治疗方法，例如局部处理、药物治疗、手术等。
因此，建议患有肛瘘的患者早期就医，接受专业医生的全面评估，并遵循医生的建议进行治疗。及早治疗肛瘘可以减轻症状、防止并发症，并提高治疗成功的机会。