儿童衣原体肺炎的确诊需要医生进行全面的临床检查和综合判断，包括以下方法：
1. 病史询问：询问患儿的病史和症状表现，了解发病时间、病情变化等情况。
2. 体格检查：检查患儿的呼吸频率、肺部听诊、体温、心率等生理指标，观察有无咳嗽、喉咙疼痛、呼吸困难等症状。
3. 血常规检查：检查患儿的血液指标，如白细胞计数、C反应蛋白等，以及是否有肺部感染的标志。
4. 胸片检查：进行X光检查来确定肺部炎症的范围和程度。
5. 衣原体检查：通过采集眼、鼻、喉、肛门等部位的分泌物或细胞，利用PCR技术等检查方法检测是否为衣原体感染。
综合分析以上检查结果，医生可以确定儿童是否患有衣原体肺炎，并给予相应的治疗。