儿童腹泻多为感染性腹泻，家长可通过日常生活干预来预防，也可采取疫苗接种的方式预防。
预防儿童感染性腹泻，要从日常的饮食入手。在食材的选择上，需选择来源可靠、安全无污染的食材，注意食材的保质时间，保证食材的新鲜。饭前便后要让孩子洗手，适当进行体育锻炼，增强体质。避免在儿童腹泻高发的季节前往空气不流通、人群密集的场所，在家中可以适当通风，以避免病原体繁殖和交叉感染。
另外，接种疫苗也是预防腹泻的有效方式。可给孩子接种口服rBS/WC疫苗（霍乱疫苗），这种疫苗对产毒性大肠杆菌或混合沙门氏菌等多种细菌感染引起的腹泻，具有良好的预防作用，且儿童疫苗配备有草莓味的抗酸剂，可直接兑水口服，儿童接受度较高。且不仅能预防霍乱，还能产生中和大肠杆菌肠毒素的抗体，避免小肠肠绒毛的破坏，防止发生营养不良和影响孩子生长发育。