蓝氧治疗通常不会有副作用，不需要担心。
用蓝氧治疗时会有一种刺激性的味道，若呼吸过多，易造成不舒服的症状，但一般不会有副作用，需要注意房间的通风。蓝氧具有强氧化性和杀菌作用，若是患有妇科疾病，可配合医生用蓝氧进行治疗。
在平时要讲究卫生，饮食以清淡为好，勿食辛辣刺激性强的食品，平时要注意食用瘦肉、鸡蛋等营养价值高的食物，来提高抵抗力。此外，要注意勤换洗内衣、节制性生活等。