连花清瘟胶囊具有退烧作用，主要适用于常见的呼吸道疾病，如感冒、流感、新冠等引起的发烧症状，建议患者在医生指导下或按照药品说明书规范服药，以缓解症状。
感冒、流感、新冠等疾病的病因在中医角度上常考虑与外邪袭肺，内有热毒蕴结有关，连花清瘟胶囊组方中含有的薄荷、麻黄可使人微微发汗，帮助让外邪从汗而出；含有的贯众、板蓝根、金银花、连翘、石膏等清泄肺部热毒；大黄可下排毒火，让体内蕴积的火热、毒素随大便下排而出，并截断病势，全方具有“清瘟解毒、宣肺泄热”的功效，可有效清除外邪、清解内热，改善发热或高热等症状，退热后不易反复。同时，对于上述疾病所致的鼻塞、流鼻涕、咽痛、肌肉酸痛等多种不适症状，该药也有治疗效果。