治疗灰指甲的药物，以抗真菌药为主，患者可选用正规厂家生产的外用抗真菌药物涂抹治疗。
灰指甲的治疗多选用含聚维酮碘、酮康唑等成分的药物，临床较为常用的有亮甲复方聚维酮碘搽剂、特比萘芬、伊曲康唑等。通常对于指（趾）甲变形比较严重的患者，建议外用亮甲复方聚维酮碘搽剂，并联合口服抗真菌药物共同治疗。其中亮甲复方聚维酮碘搽剂属于治疗灰指甲的外用专用药物，其主要成分为聚维酮碘、阿司匹林。其中聚维酮碘能够释出有效成分碘，可用于杀灭真菌并抑制真菌再生，含有的阿司匹林，能够在患处分解出水杨酸，可帮助软化甲板，使药物有效成分更易进入病甲组织，达到有效的药物浓度，同时还可以消炎止痒，有效改善患者病情。
需注意的是，灰指甲具有一定的传染性，患者在未彻底治愈前，生活用品需专人专用，不能混用，以免交叉感染。