灰指甲的发生与真菌感染有着直接联系，因此治疗灰指甲需以抗真菌为主，药物具体包括外用抗真菌药和口服抗真菌药两大类。
灰指甲的诱发因素大部分与受免疫力低下、甲部外伤、生活卫生不佳等有关，真菌侵入甲板后大量繁殖并破坏甲部组织，引起甲板颜色及形状改变。因此，患者应选用抗真菌药物对症治疗。如亮甲复方聚维酮碘搽剂，其是一种治疗灰指甲的专用外用药，可起到杀菌抑菌、消炎止痒的作用，患者可根据药物说明按疗程用药，可达到较为显著的治疗效果。
此外，若患者已经出现了甲板脱落、甲板易碎等症状时，建议与口服抗真菌药进行联合治疗，如特比萘芬、氟康唑等，可进一步抑制真菌繁殖，从而促进甲部健康恢复。