灰指甲的发生与真菌感染有关，因此建议患者选用抗真菌药物进行治疗，配合生活护理综合改善病情。
灰指甲是由真菌感染甲板或甲床所致的甲部病变，医学上叫做甲癣或甲真菌病，绝大多数患者通过外用抗真菌药物即可得到改善，如亮甲复方聚维酮碘搽剂，该药所含的聚维酮碘和阿司匹林成分，不仅可杀菌抑菌，同时还能消炎止痒，改善灰指甲引起的不适症状。如果患者症状比较严重，出现了甲板脱落、萎缩等情况，则建议在外用抗真菌药物的同时，与口服抗真菌药物，如特比萘芬、氟康唑等进行联合治疗，可较为显著的改善灰指甲。
在日常护理方面，灰指甲患者需注意保持指（趾）甲清洁，勤剪指（趾）甲，平时尽量不要与他人共用私人物品，以免引起交叉感染。