吉西滨是临床上用于中晚期NSCLC的常见化疗药，可有效治疗各种实体瘤，提高患者生存质量。然而，吉西滨也有一些不良反应，除了具有抗肿瘤作用外，还会对机体造成不良反应。
主要表现为骨髓抑制，病人可以有贫血的症状，血液检查可以发现血小板减少，中性粒细胞减少，白细胞减少。
多数病人只有轻微的肝转氨酶异常，但不会造成渐进性的损害，一般不用停止服药。但对于有肝损伤的病人，吉西滨的用量及使用要适当控制。少数病人可有恶心、呕吐、食欲减退、便秘、腹泻等不良反应。
大约50%的病人在服用氟西滨后，尿常规可表现为轻微的血尿、蛋白尿，少数病人可表现为尿素氮、血肌酐等异常，同时伴有一些临床表现，严重时可表现为肾功能衰竭，但在临床上很少见到。本药对有肾脏损害的病人要慎重应用。
少数病人可有轻微的气管抽搐，也可有呼吸困难等表现，但症状往往很轻，病程短暂，一般无需特别治疗。
患者可表现为皮疹，伴有或不伴有瘙痒，个别患者还可伴有脱皮及水泡。
除了上述不良反应，部分病人在接受吉西滨的化疗后，还会有轻微的脱发、发烧、头痛、嗜睡、口唇炎，严重的还会有心律不齐的情况。