治疗龟头炎的方法因人而异，需要针对炎症的原因进行。西医治疗的基本原则是消炎杀菌。对于急性浅表性包皮龟头炎和环状溃疡性包皮龟头炎，红霉素和四环素是首选药物，每服0.5g，每日4次。
灭滴灵则是治疗滴虫性包皮龟头炎的首选药物，每服0.2g，每天3次，连续10天。曲古霉素或伊曲康唑常用于治疗白色念珠菌引起的包皮龟头炎。曲古霉素的使用剂量为10~20万单位，伊曲康唑每天服用100次mg，一天两次，连服7天。