睾丸附睾炎的治疗方法取决于病情的轻重。对于急性睾丸附睾炎，患者应该卧床休息，抬高阴囊，早期用冰敷，晚期热敷或热水坐浴。同时，可以口服止痛药或做精索封闭，绝对禁止性生活。
对于慢性睾丸附睾炎，患者应该选用广谱的抗生素进行口服，或者采用附睾局部的等离子透入。如果病情较重，可能需要手术治疗。对于反复发作的慢性附睾炎的患者，也可以考虑做附睾切除手术。