小儿慢性附睾炎的治疗主要是采用药物和手术两种方式。
对于药物治疗，可以选择使用抗生素类的药物、解热镇痛的药物以及消肿利尿的药物等。如果病情处在急性期形成脓肿者，或者是慢性附睾炎反复发作，可以适当的采取外科手术的方式进行治疗。
在治疗过程中，还需要注意儿童的清洁和卫生，并且选择使用温水进行坐浴，以缓解症状。同时，家长应定期带儿童去医院进行检查，确保疾病得到及时有效的治疗。