霉菌性龟头炎的治疗方法包括清洗和药物治疗。可以使用生理盐水或0.1%利凡诺尔冲洗液清洗阴茎头和包皮，清除污垢。还可以使用男士抗菌液或2%碳酸氢钠溶液浸洗包皮和阴茎头。同时，可以使用皮肤康洗液，涂抹阴茎头部，每天1-2次，也有较好的效果。
此外，外用涂抹抗霉菌药膏起到抗真菌作用，如克霉唑软膏，孚琪乳膏。在治疗期间，建议避免性生活，保持卫生习惯，避免传染给他人。如果症状加重或持续存在，建议及时就医。