克霉唑乳膏是一种治疗真菌感染引起的龟头炎的广谱抗真菌药，特别对念珠菌性龟头炎有显著效果。但其对于其他病原体造成的龟头炎则无效。克霉唑乳膏通过抑制真菌细胞膜的合成来对抗真菌，适用于念珠菌等各类真菌引起的阴道炎和龟头炎。
但对于细菌和病毒引起的龟头炎则不适用。对于细菌引起的龟头炎，可以使用红霉素软膏等抗生素药物治疗。病毒如人乳头瘤病毒引起的龟头炎（尖锐湿疣的表现之一），则需要局部应用鬼臼毒素酊或咪喹莫特霜等。对于数量少，面积小的湿疣，可以局部应用冰冻疗法或激光治疗。
此外，还需要保持龟头局部的清洁，避免各种刺激，避免不洁性交，少吃辛辣刺激的食物，忌烟酒。对于已有龟头糜烂或溃疡的患者，在外用药物涂抹的情况下，可以联合坐浴治疗。