附睾炎分为急性和慢性两种。急性附睾炎通常先从附睾尾部发生，附睾管上皮水肿、脱屑，管腔内出现脓性分泌物。然后，经过间质浸润，炎症可扩散至附睾体部和头部，并可能形成微小脓肿。晚期可能形成附睾管腔闭塞。
附睾炎通常只会发生在一侧，因此对生育的影响相对较小。但是，如果双侧附睾炎都发生，那么不育的风险会大大增加。