龟头炎是一种常见的疾病，通常是由感染引起的，常见的致病菌包括革兰氏阴性细菌，如大肠埃希菌、肺炎克雷伯杆菌和变形杆菌等。这些细菌对甲硝唑不敏感，因此口服甲硝唑可能对龟头炎的疗效不大。
对于龟头炎，部分疾病由真菌、支原体或衣原体等少见病原体引起，甲硝唑同样对它们无效。然而，如果龟头炎是由阴道滴虫引起的，甲硝唑对阴道滴虫具有杀伤作用，可以用来治疗这种疾病。因此，龟头炎感染病原菌的类型对治疗非常重要。