龟头炎的药物治疗时间取决于病原体的类型、严重程度以及个人治疗方法选择。念珠菌感染引起的包皮龟头炎，一般选用克霉唑乳膏涂抹患处，进行治疗，需要大约一周时间。如果是厌氧菌引起的包皮龟头炎，一般采用口服甲硝唑的方式治疗，也需要大约一周时间。
如果是葡萄球菌、链球菌等细菌引起的包皮龟头炎，一般选用倍他米松乳膏涂抹患处进行治疗，严重时可口服抗生素进行治疗。对于包皮过长导致的包皮龟头炎反复发作的情况，医生一般会建议进行包皮环切术。因此，具体的药物治疗时间需要遵循医生的建议进行，遵循医生的治疗方案进行治疗。