治疗滴虫性龟头炎可以采用中药和西药。中药治疗通常使用金银花、防风、黄柏、薄荷、甘草等药物组方，或者川楝子、葱根、黄连、川椒、瓦松、艾叶等药物煎水后取汁液外洗。西药治疗可以使用甲硝唑软膏。
在使用药物治疗期间，患者应避免性生活，并配合中药外洗疗法。如果症状严重并引起发热和淋巴结肿大，则可全身应用抗生素和甲硝唑片剂治疗。建议在医生指导下进行治疗。