小儿七珍丸虽然治病，但副作用大。小儿七珍丸在用药后有腹痛、腹泻、神疲乏力，头晕眼花等不良反应发生，停用后上述症状通常可消失。
小儿七珍丸有漉消积导滞，通便泻火，镇惊退热，化痰息风等作用，宜在医生指导下温水服之，脾虚气虚小儿因体虚故当慎服，儿童七珍丸药性偏凉，更易损伤儿童脾胃，服后易导致体虚症状加剧，用药过程中儿童宜忌，宜勿食辛辣油腻性食。服药后如无改善需及时到医院就诊。
用药过程中应清淡进食，忌食辛辣、油腻食物。