肉苁蓉一般没有副作用，但是病人长期服用就有可能会出现上火、月经紊乱、消化不良等症状。
肉苁蓉是一种补益的药，具有补肾阳、补益气血、润燥滑肠等功效。病人按照医嘱吃肉苁蓉通常无副作用。当病人体内阴火旺时，吃了会引起体内的上火，甚至会引起大便密结，小便赤黄。
对于经期过多，月经不规律的病人，肉苁蓉有很好的治疗效果，但是不能在经期长时间吃，否则会造成经期不规律。
在使用肉苁蓉的时候，如果没有按时服药，吃多了会引起消化不良。