辣椒素的作用一般是缓解疼痛、助消化、降血脂等。
1.缓解疼痛：辣椒碱能刺激神经末端，并影响神经讯息的传导，藉此减少痛苦。所以在医药上，辣椒碱被用于治疗与关节炎，神经病等疼痛有关的疾病。
2.助消化：长时间吃辣椒素能促进肠胃蠕动，使胃酸分泌增多，同时还能激发消化酶的活性，从而达到助消化的效果。同时，辣椒碱对胃中的细菌也有一定的抑菌效果。
3.降血脂：辣椒素能降低血液中的胆固醇、三酸甘油酯及LDL，因此能降低心血管病的发病率。