百会穴疼，从中医的角度来看，可能主要是因为局部损伤瘀血所致，也可能是因为足厥阴肝经不通所致，如不能自己分辨，建议尽快到正规医院检查，并在医生指导下查明病因再加以干预。
1、局部损伤瘀血：多为外伤所致，百会穴部位淤血后，可发生局部胀痛，一般为刺痛感，并伴局部拒按。一般可在医生指导下用艾灸和微波治疗活血化瘀，待瘀血散去，疼痛便会慢慢改善；
2、足厥阴肝经不通：百会穴疼痛多由足厥阴肝经不通则头痛所致，且足厥阴肝经头痛部位位于巅顶百会穴部位，常伴头昏、胸闷、呕吐、四肢厥冷伴发。可通过针刺百会，太冲等肝经穴位，由专业医生操作疏通经络，调节气血运行以减轻痛苦。还可在中医辨证的基础上采用中药汤剂治疗，如吴茱萸与藁本相伍，对减轻痛苦有一定帮助。