山茱萸属于肝经、肾经，其药用原理在于通过滋养肝肾，促进身体素质的提升。在临床上常用于治疗腰酸背痛、心悸气短、失眠多梦等症。肝肾功能的提升将导致生殖、代谢和消化等方面的显著变化。
常与熟地黄、山药、茯苓等药物联合使用，以缓解肝肾阴虚所致的腰膝酸软、头晕耳鸣等不适症状。对于肝肾两虚、阴虚血少、头晕目眩、耳鸣咽干、午后潮热、腰腿酸痛等症状，建议使用当归、白芍、熟地黄等中药进行联合治疗。
对于脾肾亏损、冲任不固所致的崩漏、月经过多或带脉失约所致的带下不止等症状，常使用龙骨、黄芪、白术等药物进行联合治疗；后一项与莲子、芡实等同等重要，被广泛使用。