一般而言，六味地黄丸和金匮肾气丸并不适宜同时食用。
因为这两种药物都属于温补类药物，在功能上也有一定差别。尽管金匮肾气丸和六味地黄丸在中药药性之间的反应中未出现毒性或副作用，或者存在药物成分以影响药效发挥，但这并不影响之间的相互作用。所以，六味地黄丸应避免与之合用。
然而，金匮肾气丸作为一种温补药，其临床疗效在于滋养肾脏、增强阳气，同时促进气血畅通，促进水液代谢。两者都具有温补作用，但金匮肾气丸主要用于肾虚之人。六味地黄丸，一种具有滋补肾阴功效的药物，可用于治疗腰酸膝痛、遗精易勃、口燥咽干等多种疾病。
这也说明，金匮肾气丸同六味地黄丸一样具有温肾滋阴作用。此外，金匮肾气丸在六味地黄丸的基础上增加了四种药物，其中包括两种补肾阳药和两种通水药，以增强其疗效。另外，为了保证疗效，还可以使用六味地黄丸合桂枝茯苓胶囊。
因此，在需要补充肾阴阳的情况下，患者可以直接使用金匮肾气丸进行治疗，而不必同时使用六味地黄丸和金匮肾气丸等具有补肾阴阳功效的中药。若药物使用不当，其疗效不仅不尽如人意，反而可能对身体造成不良影响。