荞麦皮枕头的害处主要是容易滋生细菌和生虫。
荞麦壳是一种性凉的食物，可以用它来当枕头，还能起到活血通脉、镇静安神、益智醒脑、调和阴阳的效果，还能起到按摩颈椎的效果。不过，荞麦是一种谷物，用它做枕头，很难清洁，很容易受潮发霉；人的汗渍，头皮上的油脂，很容易滋生细菌和霉菌；并且，荞麦皮对肌肤过敏者，容易引起颈部皮肤发痒；如果有长期血糖偏低的情况，也不建议服用。
因此，要经常晾晒荞麦皮来制作枕头，最好是先将荞麦皮炒一下，然后再制作枕头。