艾灸的次序为：自上而下，从阳到阴，从左到右，从背部到腹部，从微量到丰富。这是因为人体经脉分布于全身各处，经络循行又有一定规律，因此，按照这种规律选择艾柱位置就能达到理想效果。按照艾灸的顺序，从头到胸、腹，再到四肢、背部和腹部，依次为左侧、右侧、阳经和阴经，艾灸的持续时间由短到长，穴位逐渐增多，这是一个逐步推进的过程。
在某些特殊情况下，可以采用倒序的方式进行治疗，例如在肛门脱垂的情况下，可以先对长强穴进行局部艾灸，以消散淤血，然后再进行百会的灸治。如果患者出现腹胀，应根据不同症状选择合适的灸法和剂量。请注意，艾灸的用量应逐渐递增，不宜突然增加。