芫花菟丝子酒的功效与作用主要是补益肝肾、固精缩尿、安胎、明目、止泻等。
菟丝子性平味甘，是一种具有补肾功效的药物。对于肝、肾不足的人，如腰膝酸软、阳痿、遗精，以及泌尿系疾病，肾虚引起的遗尿、尿频等，还有安胎，如漏胎、胎动不安，脾、肾虚引起的泄、久泻、久痢等。临床上也可以用来治疗肝、肾不足引起的视物不清晰、视物模糊、视力下降等症状，由于其明目的作用，可以外用去斑，一般与补骨脂合用。
制作成通常芫花菟丝子酒，一般可用于消风、祛斑等。